Сюжет игры «Перевоплощения: Тайны прошлого» разворачивается вокруг девушки по имени Джейн, которая вместе с доктором Херзлом добились большого успеха в исследованиях перевоплощения. Но Джейн похищают и забрасывают в параллельный мир, поэтому их работа с доктором становиться под угрозой. Джейн нуждается в Вашей помощи, что бы найти дорогу домой.